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基于靶标指导乳腺癌精准治疗标志物临床应用专家共识(2022版)

发表于 2021-06-20 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 共识 , 乳腺癌
原文链接 专家共识:建议采用标准流程检测乳腺原发灶和转移灶ER、PR、HER2及Ki67,根据临床分型进行预后判断和指导分类治疗,并将生物学标志物纳入TNM分期系统中,以进一步提高分期系统的精确性。新的“复旦四分型”用于指导精准分类治疗有待更大样本的基于我国人群的临床试验验证。 专家共识:建议将C ...
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共识-用药推荐的驱动突变汇总

发表于 2021-06-20 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 共识
癌种 驱动突变 治疗方案 一线治疗 肺癌 ALK 基因融合 肺癌 RET 基因融合 普拉替尼作为二线治疗的II级推荐,LOXO-292(国内未上市)为III级推荐
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非小细胞肺癌分子残留病灶专家共识

发表于 2021-06-20 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 共识
原文链接非小细胞肺癌分子残留病灶专家共识非小细胞肺癌分子残留病灶专家共识.pdf 背景由中国抗癌协会肺癌专业委员会和广东省临床试验协会/中国胸部肿瘤研究协作组主办的“第18届中国肺癌高峰论坛”于2021年3月6日在广州顺利召开。此次论坛以非小细胞肺癌(non⁃small cell lung canc ...
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共识-肿瘤二代测序临床报告解读共识

发表于 2021-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 共识
参考原文循证医学官网:肿瘤二代测序临床报告解读共识肿瘤二代测序临床报告解读共识.pdf 随着新型治疗药物的研发以及多学科综合治疗模式的优化,传统的病理分型及检测方法已经不足以满足临床需求,二代测序(next generation sequencing,NGS)已成为中国肿瘤医生常用的检测手段。为进一 ...
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肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)

发表于 2021-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 共识
共识原文链接2020.10 肿瘤突变负荷检测及临床应用中国专家共识(2020年版)肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)作为一个新兴的生物标志物,在预测肿瘤免疫治疗疗效中的作用越来越受到重视。目前 TMB 的检测方法主要是基于高通量测序平台的全外显子测序和靶向 Pan ...
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Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants

发表于 2021-02-19 | 分类于 NGS , 标准化 , 遗传分析
ACMG发布的遗传变异分类标准与指南
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Standards and Guidelines for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants in Cancer

发表于 2021-02-19 | 分类于 NGS , 标准化 , 遗传分析
肿瘤体系系变异解读指南
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Characterization and mitigation of fragmentation enzyme-induced dual stranded artifacts

发表于 2020-10-02 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 文献
DNA片段化是基于杂交捕获的短读长测序文库制备过程中的基本步骤。文库制备包括DNA片段化过程中引入的错误,会显著影响下游的分析,并直接导致假阳性和假阴性的增加。目前主流的DNA片段化方法有两种: 基于超声波进行的物理打断,(超声打断本身比较昂贵(仪器上万)和耗时(每个样本几分钟),但是会带来一些样本 ...
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RPKM, FPKM and TPM

发表于 2019-03-02 | 分类于 RNA
RPKM, FPKM and TPM, clearly explained
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SGE任务调度系统相关命令记录

发表于 2019-02-23 | 分类于 Linux , 任务调度
http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/ http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/htmlman1/qstat.html?pathrev=V62u5_TAG sge系统管理命令队列信息查询 #### ...
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