酶改造-modelpaper-ProtT5框架详解 置顶 | 发表于 2026-04-02 | 分类于 知识 ProtT5 的 T5 编码器—解码器骨架、相对位置注意力、与原版 T5 去噪目标的差异;ProtT5-XL-UniRef50 的训练数据、掩码策略、初始化与超参;嵌入提取与下游使用注意。 阅读全文 »
酶改造-05.ESM 框架详解 置顶 | 发表于 2026-03-30 | 分类于 知识 面向无 Transformer 基础的读者:用比喻与示意图说明 ESM 的掩码预训练、编码器结构、自注意力与残差块;并梳理 ESM-1→ESM-2/ESMFold→ESM-3 的代际迭代与多模态范式差异。 阅读全文 »
酶改造-04.模型架构-PLMs 置顶 | 发表于 2026-03-30 | 分类于 知识 蛋白质语言模型(PLMs)的发表脉络、Transformer 框架结构、代表模型的参数与训练数据、典型训练成果及在酶工程等领域的应用。 阅读全文 »
酶改造-03.聚合酶筛选的开源训练数据汇总 置顶 | 发表于 2026-03-30 | 分类于 知识 面向酶与聚合酶相关建模的公开序列、动力学、结构与深度突变扫描类数据资源汇总;补充各库数据信息维度、许可、使用注意与可复现下载链接。 阅读全文 »
酶改造-03.蛋白各类性能预测相关的工具 置顶 | 发表于 2026-03-30 | 分类于 知识 面向酶与聚合酶相关建模的公开序列、动力学、结构与深度突变扫描类数据资源汇总;补充各库数据信息维度、许可、使用注意与可复现下载链接。 阅读全文 »
酶改造-02.聚合酶筛选方法的发展脉络 置顶 | 发表于 2026-03-30 | 分类于 知识 从合理设计、随机突变与 DNA shuffling,到微孔板与液滴高通量、测序偶联筛选,再到计算与 PLM 指导的迭代改造脉络梳理。 阅读全文 »
酶改造-01.聚合酶的评估指标 置顶 | 发表于 2026-03-30 | 分类于 知识 聚合酶改造中常用的催化动力学、保真度、持续合成能力、热稳定性与底物谱等评估维度,以及指标与筛选、建模标签的对应关系。 阅读全文 »
Argo Workflows 常用命令(投递、跟踪与排障) 置顶 | 发表于 2026-03-24 | 分类于 调度框架 面向 CRD API argoproj.io/v1alpha1,从投递、跟踪、排障到清理梳理 Argo Workflows CLI 常用命令与 kubectl 对照示例。 阅读全文 »
01.图数据库.md 置顶 | 发表于 2026-03-20 最近路上听博客,看到图数据库,其实前段时间看机会的时候,也经常看到一些关系型数据库的需求,但是其实自己对这方面之前毫无涉猎,所以。嗯,我又跳开openclaw的怀抱了,有几篇笔记,后续会先发出来。 从“关系”中挖掘价值:图数据库全面解析在数据爆炸的时代,我们通常习惯于将数据存放在规整的表格中。无论 ... 阅读全文 »
Linux-运维管理-用户管理.md 置顶 | 发表于 2026-03-18 | 分类于 Linux 本文主要包含两部分内容: 新建一个用户 允许该用户以管理员身份执行命令(在使用服务器的时候,不建议给予普通用户管理员权限) 注:本文基于Ubuntu系统的主机名为HPZ640-1,用户名为mqk,进行创建与删除的新用户名为tt 创建用户创建用户有两条命令: adduer 和 useradd ,对 ... 阅读全文 »