从热力学与动力学框架、锁钥与诱导契合模型出发，逐区说明 VH/VL、六条 CDR、FR、CH1–CL 及铰链在抗体–抗原结合中的功能；归纳表位类型、结合各阶段、效率指标（KD、kon、koff、avidity）与影响结合效率的关键因素。

Linear、ReLU、Softmax+CrossEntropy、LayerNorm 等常见层的 forward/backward 公式与 shape 表。

计算图、前向/反向模式、局部梯度与全局梯度乘积、模块化 backward 及与 autograd 的对应。

Jacobian 矩阵定义、向量函数链式法则、维度对齐规则及与反向传播的衔接。

标量对向量的导数、常用公式表、二次型与范数梯度及 MSE 线性回归梯度推导。

生物药研发语境下「生物表征」与「分子功能」的定义与边界；转录组/蛋白组在表征中一般关注的分析内容（分层、场景、交付物）；二者关系与系列文档对照。

系统梳理抗体–抗原亲和力实验测定、基准数据集与计算预测工具：按物理能量、结构机器学习、序列深度学习与排序学习分类，比较各工具原理、适用场景、优劣势与共性局限，并给出选型建议。

接续 AMD ROCm 部署实践，聚焦「相对 vLLM 推理多出来的」依赖、数据、训练与评估操作，说明 LoRA 微调在 ROCm 单卡上的关键配置与注意事项。

矩阵微积分总论：分子布局约定、梯度与 Jacobian、与标量微积分及 Math-04 优化的衔接。

MISEV2023（细胞外囊泡研究最低信息）核心内容中文汇总：版本演进、五大核心问题、命名规范、样品与分离、五组分蛋白框架、表征、功能与体内研究、EV-TRACK 及与本系列 QC 体系的对应。