芯片设计(Panel-Design)
一些科学性的研究，是基于WGS的，但是几遍随着测序成本的不断下降，全基因组测序对患者来讲仍然是非常高昂的成本，成为一个肿瘤检测面临的问题。尤其是许多检测需要进行相关的体细胞检测，尤其是部分临床需求要求非常低的检测限（从再起的10%、5%到现在的3%、1%，甚至目前部分特定需求的产品会要求检测限达到1‰的水平，而全基因检测这个水平的变异需要的数据量即便对偶发性的科研项目而言都是极高的成本，更惶论应用于临床。因此确定一个合理的芯片设计方案，应用靶向捕获技术，特异性捕获特定区域进行定向测序，可以更经济的实现重点区域的高深度测序。在尽可能经济的条件下，满足高灵敏性的临床检测需求。
数据分析模型 - 波士顿矩阵
波士顿矩阵（BCG Matrix），又称市场增长率-相对市场份额矩阵，由美国著名的管理学家、波士顿咨询公司创始人布鲁斯·亨德森于1970年首创，它是通过销售增长率（反应市场引力的指标）和市场占有率（反应企业实力的指标）来分析决定企业的产品结构。
波士顿矩阵将产品类型分为四种：
1，明星类产品：高增长
...
随机森林（Forest Tree)
发表于
|
分类于
机器学习
介绍随机森林 (Random Forests) 是一种利用决策树作为基学习器的 Bagging 集成学习算法。随机森林模型的构建过程如下：
数据采样作为一种 Bagging 集成算法，随机森林同样采用有放回的采样，对于总体训练集 (T)，抽样一个子集 (T_{sub}) 作为训练样本集。除此之外，假
...
TMB简介及华大相关进展
TMB的出现及发展TMB 基本现状定义
WES：
TMB是指肿瘤基因组内存在的体细胞突变位点数量，可以间接反映肿瘤产生新生抗原的能力。由于早期研究多基于WES检测，因此TMB通常是指单位基因组外显子编码区域（外显子组，exome）的突变数量（mutations, muts），单位为muts/exo
...