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git 常用命令及相关参数

发表于 2020-02-20 | 分类于 编程拾慧 , Git
Git是一个开源的分布式版本控制系统,可以有效、高速地处理从很小到非常大的项目版本管理。
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RPKM, FPKM and TPM

发表于 2019-03-02 | 分类于 RNA
RPKM, FPKM and TPM, clearly explained
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SGE任务调度系统相关命令记录

发表于 2019-02-23 | 分类于 任务调度 , Linux
http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/ http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/htmlman1/qstat.html?pathrev=V62u5_TAG sge系统管理命令队列信息查询 #### ...
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git 安装配置及基本概念

发表于 2019-02-20 | 分类于 编程拾慧 , Git
Git是一个开源的分布式版本控制系统,可以有效、高速地处理从很小到非常大的项目版本管理。
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天河二号作业调度系统简单使用

发表于 2018-12-07 | 分类于 任务调度
天河用户手册天河用户手册 现将天河2号的作业调度系统的简单使用方法记录于此: MPI天河2号默认使用mpich-3.2.1(使用icc-14.0.2 编译),是天河2号自主实现的mpi版本,具有较高的效率。 module 模块管理1234567module avail ...
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爬虫学习记录-相关软件&包记录

发表于 2018-11-22 | 分类于 编程拾慧 , python
爬虫学习过程涉及的软件: 软件1. Python3.5.5整体爬虫代码的框架语言,所有Python程序及包均基于本版本。 2. chromeDriver模拟登陆chrome浏览器,驱动浏览器完成相关操作。 3.PhantomJS - 官方文档一个无界面的,可脚本编程的WebKit浏览器引擎,原生支持 ...
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下机数据(fastq)质控软件汇总

发表于 2018-11-19 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , software
下机数据质控,是NGS数据分析中的第一步,因此也是接触二代测序所必须学习的一部分,今天主要在这里记录下一些主流的数据质控软件,后续有时间,也可以考虑对这些数据进行一个系统的评估。
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肿瘤组Linux培训资料

发表于 2018-11-01 | 分类于 Linux , 内部培训材料
肿瘤组内部培训材料
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常用shell命令 - time

发表于 2018-10-08 | 分类于 Linux
time是linux内置的一个计算统计任务运行时间的命令,同时还可以统计任务运行的内存、I/O资源。
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参考基因组版本问题汇总

发表于 2018-07-11 | 分类于 NGS , 知识沉淀 , 肿瘤检测 , 数据库
不同版本参考基因组的位置坐标转换在使用参考基因组时,经常会遇到一些版本的问题,比如使用注释文件和bed文件时,不同版本的位置坐标不能直接使用,这时候,我们就需要对坐标进行转换,这里记录下一些常用的坐标转换工具: 类型 支持格式 地址 推荐指数 Liftover 在线 bed http ...
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