爬虫学习记录-相关软件&包记录 发表于 2018-11-22 | 分类于 编程拾慧 , python 爬虫学习过程涉及的软件: 软件1. Python3.5.5整体爬虫代码的框架语言,所有Python程序及包均基于本版本。 2. chromeDriver模拟登陆chrome浏览器,驱动浏览器完成相关操作。 3.PhantomJS - 官方文档一个无界面的,可脚本编程的WebKit浏览器引擎,原生支持 ... 阅读全文 »
下机数据(fastq)质控软件汇总 发表于 2018-11-19 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , software 下机数据质控,是NGS数据分析中的第一步,因此也是接触二代测序所必须学习的一部分,今天主要在这里记录下一些主流的数据质控软件,后续有时间,也可以考虑对这些数据进行一个系统的评估。 阅读全文 »
常用shell命令 - time 发表于 2018-10-08 | 分类于 Linux time是linux内置的一个计算统计任务运行时间的命令,同时还可以统计任务运行的内存、I/O资源。 阅读全文 »
参考基因组版本问题汇总 发表于 2018-07-11 | 分类于 知识沉淀 , NGS , 数据库 , 肿瘤检测 不同版本参考基因组的位置坐标转换在使用参考基因组时,经常会遇到一些版本的问题,比如使用注释文件和bed文件时,不同版本的位置坐标不能直接使用,这时候,我们就需要对坐标进行转换,这里记录下一些常用的坐标转换工具: 类型 支持格式 地址 推荐指数 Liftover 在线 bed http: ... 阅读全文 »