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ESM 框架详解

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , 酶与结构
面向无 Transformer 基础的读者:用比喻与示意图说明 ESM 的掩码预训练、编码器结构、自注意力与残差块;并梳理 ESM-1→ESM-2/ESMFold→ESM-3 的代际迭代与多模态范式差异。
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模型架构-PLMs

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , 酶与结构
蛋白质语言模型(PLMs)的发表脉络、Transformer 框架结构、代表模型的参数与训练数据、典型训练成果及在酶工程等领域的应用。
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酶改造:聚合酶筛选的开源训练数据汇总

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , 酶与结构
面向酶与聚合酶相关建模的公开序列、动力学、结构与深度突变扫描类数据资源汇总;补充各库数据信息维度、许可、使用注意与可复现下载链接。
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酶改造:各阶段性能预测工具

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , 酶与结构
面向酶与聚合酶相关建模的公开序列、动力学、结构与深度突变扫描类数据资源汇总;补充各库数据信息维度、许可、使用注意与可复现下载链接。
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酶改造:聚合酶筛选方法的发展脉络

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , 酶与结构
从合理设计、随机突变与 DNA shuffling,到微孔板与液滴高通量、测序偶联筛选,再到计算与 PLM 指导的迭代改造脉络梳理。
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酶改造:聚合酶的评估指标

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , 酶与结构
聚合酶改造中常用的催化动力学、保真度、持续合成能力、热稳定性与底物谱等评估维度,以及指标与筛选、建模标签的对应关系。
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Kubernetes:存储网络与权限入门

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工程实践 , Pipeline
Kubernetes 系列 05:卷与 PVC/PV/StorageClass 的声明与供给关系;Service 与 Endpoints、kube-proxy;Ingress 占位说明;RBAC(Role/Binding 与 ServiceAccount)及 Pod 访问 API 的直觉。
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Kubernetes:工作负载与资源调度

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工程实践 , Pipeline
Kubernetes 系列 04:Deployment/Job/CronJob 差异;requests 与 limits 与调度及 OOM 的关系;Pending 与常见原因排查顺序;与 k8s-01 图 5 步骤 4~5、Argo 的对应关系。
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Kubernetes:kubectl与日常观测

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工程实践 , Pipeline
Kubernetes 系列 03:kubectl 与 kube-apiserver 的关系、kubeconfig 与上下文;命名空间隔离;get/describe/logs/exec 最小观测闭环;与 Argo 场景下查找 Pod 与日志。
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Kubernetes:集群与运行环境

发表于 2026-03-30 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工程实践 , Pipeline
Kubernetes 系列 02:「集群」在动手层面的含义;本地 kind/minikube、自建与托管三条路径;托管模式下云厂商与用户的责任分界;与 Argo、单机 Docker 的边界。
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