RAG-本地部署时间 发表于 2025-04-12 | 分类于 LLM , RAG tinyRAG 一个手搓实现项目,使用代码,从底层实现了一个 RAG 框架,包含如何进行文档的分块,向量化,建库,基于提问如何在向量库中检索相关的文本块,然后将文本块作为上下文嵌入到prompt中,然后更新问题(加入参考信息)给LLM进行回答。其中的不管是文本导入,文档分块,向量化,数据库中知识块的 ... 阅读全文 »
引物设计相关工具-Primer3 发表于 2025-04-11 | 分类于 引物设计 引物设计工具Primer3Primer3是一个常用的引物设计工具,可以自动计算引物长度、GC含量和Tm值,并提供详细的分析结果。Primer3官网Primer3 参数参考说明 参考引物设计代码123456789101112131415161718192021222324252627282930313 ... 阅读全文 »
pipeline-container-Singularity-常用命令 发表于 2025-03-14 | 分类于 Tobeinsert 运行一个镜像启动服务1singularity instance mysql 查询容器列表1singularity instance list 输出示例如下:123INSTANCE NAME PID IP IMAGEtest1 1234 ... 阅读全文 »
pipeline-frameworks-cromwell-03.数据库配置 发表于 2025-03-12 | 分类于 Tobeinsert mysql 镜像获取https://github.com/PSC-PublicHealth/mysql-singularity-container/blob/master/README.md 启动singularity 服务一次执行如下shell sh instance.sh 123456#!/b ... 阅读全文 »
文档解析-pdf文档解析 发表于 2025-02-26 | 分类于 Tobeinsert PP-DocLayoutPP-DocLayout 系列提供了三个不同尺度的模型 高精度模型:PP-DocLayout-L,GPU 上每个页面端到端推理耗时 13.4 ms 精度和效率均衡模型:PP-DocLayout-M,GPU 上每个页面端到端推理耗时 12.7ms 高效率模型:PP-DocLa ... 阅读全文 »
5013.大模型-调用api - 多模态调用 发表于 2025-02-24 | 分类于 LLM openai-api官方文档通义千问API参考 测试链接是否成功1234curl https://api.openai.com/v1/models \ -H "Authorization: Bearer $OPENAI_API_KEY" \ -H "OpenAI-Organization: YO ... 阅读全文 »
5013.大模型-调用api - 进阶调用 发表于 2025-02-24 | 分类于 LLM openai-api官方文档简单使用示例, 提供模型的地址,提供调用的模型和消息,即可调用大模型。1234567891011121314151617from openai import OpenAI# 配置大模型的ip和Keyclient = OpenAI( api_key=api_key, # ... 阅读全文 »
引物设计的整体设计原理 发表于 2025-02-20 | 分类于 引物设计 引物设计考虑因素引物的基因特性 引物长度:引物长度一般在15-30个碱基之间,常用长度为18-24个碱基。过短的引物可能导致特异性不足,而过长的引物则可能增加成本和非特异性扩增的风险。 GC含量:应控制在40%-60%之间。过高或过低的GC含量会影响引物的稳定性和扩增效率。 Tm值:引物的Tm值(退 ... 阅读全文 »
Python-包-Flask-api开发 发表于 2025-02-20 | 分类于 Tobeinsert Flask是一个Python编写的Web 微框架,可以快速实现一个网站或Web服务。Flask官方文档 基础示例12345678910111213from flask import Flask#1、首先我们导入了 Flask 类。 该类的实例将会成为我们的 WSGI 应用。app = Flask(_ ... 阅读全文 »