免疫组库
概念什么是免疫组库从出生开始，人体每天都会受到大量外来物质的侵扰，但并不会每天得病。这是因为人类在演化的过程中，拥有了一套强大的免疫系统来对抗外来物质的入侵，这些物质称为抗原(Antigen)。免疫系统包括物理屏障、非特异性免疫、特异性免疫系统。T/B 细胞是特异性免疫系统的两大细胞群。免
...
cromwell介绍 - 后端配置
Cromwell 是 Broad Institute 开发的工作流管理系统。通过 Cromwell 可以将 WDL 描述的 workflow 转化为批量计算的作业（Job）运行。是目前非常流行的一个用于生物信息学的开源工作流程管理系统。软件本身有专门的文档管理站点 Cromwell Readthe
...
cromwell 配置文件-设置任务投递模式
上一篇文章，我们介绍了 run 模式，并且针对常见的分析场景 SGE & docker 介绍了基本配置文件的撰写方式，及指定配置文件进行任务投递的方法。
1java -Dconfig.file=/path/to/yourOverrides.conf cromwell.jar run pip
...
docker - 常用命令 - 查看日志
Docker is a platform that allows you to “build, ship, and run any app, anywhere.”
概念解析 线程进程核心cpu
发表于
|
更新于
|
分类于
生物信息
概念解析物理 cpu 数（physical cpu）指主板上实际插入的 cpu 硬件个数（socket）。（但是这一概念经常被泛泛的说成是 cpu 数，这很容易导致与 core 数，processor 数等概念混淆，所以此处强调是物理 cpu 数）。由于在主板上引入多个 cpu 插槽需要更复杂的硬件
...
CNV检测-CNVKit
Detection of Exon Copy Number variants (DECoN) 是一款CNV检测工具，适用于exon-based的panel测序，可以识别single exon CNV