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Use of synthetic DNA spike-in controls (sequins) for human genome sequencing

发表于 2022-03-14 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息 , NGS
developed a set of synthetic DNA spike-ins—termed ‘sequins’ (sequencing spike-ins)—that are directly added to DNA samples before library preparation. Sequins can be used to measure technical biases and to act as internal quantitative and qualitative controls throughout the sequencing workflow.
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Software-varscan-变异检测

发表于 2022-03-13 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , 软件工具
variant detection in massively parallel sequencing data
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Software-PennCNV-基于SNP位点进行CNV检测

发表于 2022-03-13 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , 软件工具
variant detection in massively parallel sequencing data
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Software-终端工具-MobaxTerm

发表于 2022-03-08 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , Windows
SSH 为 Secure Shell 的缩写,是目前较可靠,专为远程登录会话和其他网络服务提供安全性的协议。利用 SSH 协议可以有效防止远程管理过程中的信息泄露问题。每天都需要与linux服务器打交道,有很多人直接使用linux系统,比如ubuntu和centos等。但是也有很多人不喜欢linux ...
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Software-transvar_变异坐标转换

发表于 2022-03-07 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , 软件工具
坐标转换基因组学研究中经常会进行的操作是将测序检测得到的染色体侧面的变异检测结果(SNV、InDel等),注释到基因上,因为大多数功能研究和蛋白研究都是针对基因进行的,将变异注释到基因上,可以更好的帮助我们预测变异对基因表达,和蛋白合成过程中带来的影响,而这个层级的影响可以帮助我们更好的进行功能组学 ...
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基本配置

发表于 2022-03-03 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , Windows
配置文件说明vscode本身可以支持多个配置文件,可以针对不同的项目(python项目、go项目、博客项目),不同分辨率的显示器(主/副屏),构建不同的配置文件,来快速适配不同的项目需求,同时也避免每次都启动过多的冗余插件。vscode的所有配置信息,都会以 json 的形式保存在sett ...
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进阶设置

发表于 2022-03-03 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , Windows
代码片段创建特定代码片段用到vscode的同学,大部分都是要进行代码开发工作的。而代码开发为了保证代码的可追溯、可查询、可维护等相关诉求,势必会对代码编写提出诸多的规范性要求和标准,以有效的提高项目协作和复杂代码的生命周期。这些规范/标准会要求我们在进行代码开发时,记录项目/代码 ...
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VS_Code-提升效率的配置

发表于 2022-03-03 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , Windows
所有常用插件可以通过账号进行多机器的自动同步! 体验优化vscode-icons让 vscode 资源树目录加上图标,提高不同类型文件/目录的辨识度。描述性的图标可以帮你区分不同的文件和文件夹。图标也让开发过程更有趣。下面是两个VSCode标签页的比较。一个有图标,另一个没有。有许多图标扩 ...
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VS_Code-提升效率的配置

发表于 2022-03-03 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 工具与环境 , Windows
Python解析器选择Ctrl+Shift+p ==》 python: Select Interpreter ==》选择所需环境
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MobaXterm 配置

发表于 2022-03-01 | 更新于 2026-08-28 | 分类于 生物信息
MobaXterm 的常用插件,提高效率。
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