hexo博客文章优化 发表于 2018-04-19 | 分类于 hexo 博客文章添加折叠功能博客文章中,有些内容篇幅较大,但是可能对一部分读者来说,并不会特别关注,所以这些数据的展示,可能会直接导致整篇博文变得臃肿,而对另一部分读者,这部分详细的介绍却非常重要,因此不能简单的缩减博文,所以这个时候,针对文章中这部分篇幅较大的内容,增加折叠功能可以很好的解决这类问题。 在 ... 阅读全文 »
R绘图-ggplot-箱线图绘制 发表于 2018-04-18 | 分类于 编程拾慧 , R 数据处理过程中,好的数据展示,可以帮助我们更好的理解数据,发现数据之间的关系,记录下各种常见的绘图方式。 结果示例箱线图上方标注的为每个样品对应的中位数,可以根据需要进行调整。 绘图命令1Rscript ../ggplot_boxplot.R -i ggplot_boxplot.demo.data ... 阅读全文 »
Linux配置文件~/.bashrc设置 发表于 2018-04-13 | 分类于 Linux 一个好的Linux环境配置可以显著的提高我们的工作效率,改善我们的工作环境,所以在这里记录下一些常用的配置设置,同时也记录下一下常见问题的解决方案。 阅读全文 »
BASH的基本语法 发表于 2018-04-13 | 分类于 Linux Bash是多数Linux发行版本的默认shell,不同的shell之间的基本语法是相通的,通过学习bash,可以让我们对不同的shell都有一个基本的了解。 阅读全文 »
samtools-安装 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , Linux Samtools在Linux环境下的安装过程记录,因为是初始开始安装,缺少多个依赖,所以记录下来以备后用。 阅读全文 »
CNV检测-DECoN 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , R , Linux Detection of Exon Copy Number variants (DECoN) 是一款CNV检测工具,适用于exon-based的panel测序,可以识别single exon CNV 阅读全文 »
CNV检测-调研 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , R , Linux 调研已发表的工具和市场上的相关竞品,整理现有ExonCNV检测方法的性能表现。 阅读全文 »
CNV检测-调研 发表于 2018-04-09 | 分类于 NGS , software , 编程拾慧 , R , Linux Detection of Exon Copy Number variants (DECoN) 是一款CNV检测工具,适用于exon-based的panel测序,可以识别single exon CNV 阅读全文 »