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Python-包-运行日志-rich

发表于 2018-06-10 | 分类于 编程拾慧 , python
Rich is a Python library for writing rich text (with color and style) to the terminal, and for displaying advanced content such as tables, markdown, a ...
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Python 单元测试

发表于 2018-06-10 | 分类于 编程拾慧 , python
单元测试(又称为模块测试, Unit Testing)是针对程序模块(软件设计的最小单位)来进行正确性检验的测试工作。程序单元是应用的最小可测试部件。在过程化编程中,一个单元就是单个程序、函数、过程等;对于面向对象编程,最小单元就是方法,包括基类(超类)、抽象类、或者派生类(子类)中的方法。如果发现 ...
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Python包-lifelines

发表于 2018-06-10 | 分类于 编程拾慧 , python
lifelines is a complete survival analysis library, written in pure Python.
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Python-高效的读写大型数据

发表于 2018-06-10 | 分类于 编程拾慧 , python
python目前最常用的数据处理包。
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变异检出标准化-HGVS

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 标准化 , 肿瘤检测
在肿瘤分析中,包括对其他的数据样本进行重测序分析的过程中,变异检测的第一步就是需要进行序列的比对,然后根据比对结果进行变异检测,但是如果不进行标准化,会导致一些发生在重复区域的缺失等不能很好的
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肿瘤NGS检测方法开发方法学 - MSK方法学资料

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 肿瘤检测 , 方法学
参考资料EVALUATION OF AUTOMATIC CLASS III DESIGNATION FOR MSK-IMPACT (Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets)A Hybridization Capture-B ...
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变异检出标准化-HGVS (Human Genome Variation Society)

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 标准化 , 肿瘤检测
在肿瘤分析中,包括对其他的数据样本进行重测序分析的过程中,变异检测的第一步就是需要进行序列的比对,然后根据比对结果进行变异检测,但是如果不进行标准化,会导致一些发生在重复区域的缺失等不能很好的
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变异注释功能标准化 - Sequence Ontology

发表于 2018-06-05 | 分类于 NGS , 标准化 , 肿瘤检测
参考资料参考网站新版网站github网址 为什么要标准化?
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流程图绘制 - diagrams

发表于 2018-06-05 | 分类于 software , Windows , Mac
安装Web在线版本本地版安装 支持Windows、Mac、Linux等。也可以使用 VS code进行相关流程图的绘制,需要安装Draw.io VS Code Integration 扩展。 介绍软件的使用,都是可以通过UI进行拖拽操作的,因此整体使用较为简单,在此不进行赘述。但是在此稍微介绍一些整 ...
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R绘图 - ggplot常用参数记录

发表于 2018-05-16 | 分类于 编程拾慧 , R
数据读取如果计划使用ggplot绘图,推荐使用数列方式整理数据,数据之间用tab分割。读取后,默认是数据框格式。然后然后根据所要绘制的图片,对数据进行解析。 折叠代码示例 Type Cancer TMB Plasma hepatocellular_carcinoma 9.74358974 ...
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